Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SbdsP70122 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms