Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnab1P63143 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms