Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrb3P63080 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms