Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps27aP62983 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps27aP62983 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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