Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3P62908 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3P62908 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps3P62908 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3P62908 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms