Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd1P62315 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd1P62315 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms