Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lmo4P61969 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo4P61969 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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