Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s1P61967 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms