Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga11P61622 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms