Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd6P61407 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms