Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PlnP61014 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PlnP61014 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PlnP61014 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PlnP61014 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PlnP61014 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PlnP61014 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PlnP61014 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms