Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2iP60898 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms