Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sem1P60897 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sem1P60897 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms