Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ActbP60710 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ActbP60710 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ActbP60710 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ActbP60710 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ActbP60710 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ActbP60710 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ActbP60710 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ActbP60710 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ActbP60710 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ActbP60710 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ActbP60710 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms