Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hps5P59438 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hps5P59438 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hps5P59438 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hps5P59438 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms