Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ythdf1P59326 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms