Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp3P59055 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csrnp3P59055 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms