Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpdl3bP58242 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms