Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn18P56857 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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