Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bace1P56818 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bace1P56818 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms