Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SmoP56726 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SmoP56726 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmoP56726 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmoP56726 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmoP56726 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmoP56726 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmoP56726 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmoP56726 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SmoP56726 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SmoP56726 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SmoP56726 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SmoP56726 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SmoP56726 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms