Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lim2P56563 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lim2P56563 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lim2P56563 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms