Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AgrpP56473 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AgrpP56473 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms