Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1bbP56400 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms