Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp5P56399 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms