Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CartptP56388 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CartptP56388 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CartptP56388 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CartptP56388 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CartptP56388 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CartptP56388 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CartptP56388 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CartptP56388 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CartptP56388 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CartptP56388 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CartptP56388 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CartptP56388 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CartptP56388 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CartptP56388 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms