Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HccsP53702 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HccsP53702 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HccsP53702 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HccsP53702 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HccsP53702 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms