Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms