Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnfP51944 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnfP51944 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcnfP51944 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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