Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr4P51680 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms