Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc4P51655 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms