Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkn1cP49919 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkn1cP49919 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms