Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcls1P49710 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms