Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpreP49446 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PtpreP49446 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpreP49446 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms