Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epb42P49222 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms