Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CitP49025 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CitP49025 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CitP49025 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CitP49025 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CitP49025 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CitP49025 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CitP49025 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CitP49025 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CitP49025 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CitP49025 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms