Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LmnaP48678 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LmnaP48678 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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