Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms