Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcd1P48410 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcd1P48410 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms