Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VdrP48281 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VdrP48281 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VdrP48281 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VdrP48281 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VdrP48281 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VdrP48281 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VdrP48281 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VdrP48281 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VdrP48281 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms