Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms