Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl13P47963 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl13P47963 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms