Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rplp1P47955 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rplp1P47955 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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