Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli1P47806 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gli1P47806 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gli1P47806 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms