Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms