Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx2-6P43688 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-6P43688 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-6P43688 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nkx2-6P43688 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms