Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tac1P41539 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms