Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl28P41105 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl28P41105 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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