Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syt4P40749 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt4P40749 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms