Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TfamP40630 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TfamP40630 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TfamP40630 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TfamP40630 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms